PatchMan attualmente supporta le seguenti applicazioni:
- Wordpress (3.x)
- Joomla (1.5.x e versioni successive)
- Drupal (5.x e successive)
- osCommerce (2.2)
- Magento
- PrestaShop
- Gallery
- MediaWiki
- MODx
- ownCloud
- phpBB
- LimeSurvey
Attenzione per alcune applicazioni PatchMan avvisa solo le versioni non aggiornate.
Queste applicazioni non saranno automaticamente aggiornate (patch), è pertanto fondamentale aggiornare manualmente l'applicazione ogni volta che una nuova versione è disponibile.